很多IVD企業(yè)在開展臨床試驗研究時經(jīng)常會碰到這樣的問題:臨床入組樣本量應具有統(tǒng)計學參考意義,,但在沒有相關(guān)產(chǎn)品臨床試驗CS指南文件的情況下,,不清楚應該怎么去確定產(chǎn)品需要入組多少樣本量,。
今天,,IVDEAR團隊為您分享一些比較常用且非常實用的臨床樣本量的確定方法。
01
常見的定性試劑的樣本估算原理和公式
1.?《體外診斷試劑臨床試驗技術(shù)指導原則》介紹了基于統(tǒng)計學要求的最低樣本量估計的相關(guān)公式,。根據(jù)臨床需要設定適當?shù)呐R床可接受標準,,也就是單組目標值法樣本量估算法,是采用下面公式分別估算陽性和陰性樣本,。?
n:樣本量,;
α:一類錯誤概率,一般設定為雙側(cè)0.05或單側(cè)0.025,;
β:二類錯誤概率,,設定為不大于0.2,一般按0.2計算,;
Z(1-α/2):顯著性水平的標準正態(tài)分布的分數(shù)位,,Z(0.975)=1.96;
Z(1-β):把握度的標準正態(tài)分布的分數(shù)位,,Z(0.8)=0.84,;
P0:評價指標的臨床可接受標準;
PT:試驗體外診斷試劑評價指標預期值,;
(PT- P0):總體參數(shù)差異,。?
估算示例1:首先將提前公式輸入,然后在E,H列分別輸入靈敏度可接受標準85%和靈敏度預期值94%,,可計算得出陽性樣本至少需100例(有小數(shù)建議進一位取整,其他案例同理),,考慮10%的脫落率計算后,,可計算得出陽性樣本至少需111例。
?Fig. 1 估算示例1
同理,,可在E,H列分別輸入特異性可接受標準90%和特異性預期值95%,,計算得出陰性樣本至少需264例(如Fig1, 右)。
2.?根據(jù)需要,,只保證評價指標滿足期望精度水平(置信區(qū)間的寬度一定),,而不設定臨床可接受標準的情況,可采用如下公式:
公式中:
n:樣本量,;
Z(1-α/2):顯著性水平的標準正態(tài)分布的分數(shù)位,,一般設定為雙側(cè)0.05或單側(cè)0.025;
Z(0.975)=1.96,;
P為評價指標預期值,,Δ為P的允許誤差大小。
采用上述公式,可根據(jù)靈敏度或特異度的預期值分別估算具有目標疾病狀態(tài)的受試者(陽性)或不具有目標疾病狀態(tài)的受試者(陰性)的樣本量,。
估算示例2:按照示例1中方式一步一步提前輸入公式即可,。分別輸入預期靈敏性85%和預期特異性95%,允許誤差Δ設定為0.05,,依次可計算得出陽性樣本至少需218例,,陰性性樣本至少需82例(考慮10%脫落率)。
注:上述方程是基于二項分布的正態(tài)近似,,當TPF或FPF接近1.0時,,這個假設就失效了。
3. 另外,,當靈敏度或特異度小于20%或大于80%時,,樣本率的分布呈偏態(tài),需對符合率的平方根進行反正弦轉(zhuǎn)換,,樣本量計算公式為:
公式中:
n:樣本量,;
Zα:1.96;
σ:一般取0.08,;
p:靈敏度或特異性的符合率,。
估算示例3:假設預期靈敏度85%和預期特異性80%,允許誤差Δ設定為0.05,,依次可計算得出陽性樣本至少需84例,,陰性性樣本至少需106例(考慮10%脫落率)。
02
定量檢測的樣本量估算
定量檢測可根據(jù)相關(guān)系數(shù)估算樣本量,,公式計算,,公式如下:
公式中:
n:樣本量;
a:一類錯誤概率,,設定為雙側(cè)0.05或單側(cè)0.025,;
β:二類錯誤概率,一般按0.2計算,;
Z(1-α/s)和Z(1-β)表示對應于α和β的標準正態(tài)分布百分位數(shù),;
s這里指的是單側(cè)或雙側(cè)檢驗,s=1為單側(cè),,s=2為雙側(cè),;
p0為相關(guān)系數(shù)可接受標準值,p1為預期相關(guān)系數(shù)值,。
估算示例4:根據(jù)CLSI EP9-A2文件的標準,,對比試劑與候選試劑的直線相關(guān)系數(shù)不得低于0.975(p0),那我們假設線性系數(shù)為0.985(p1)設定單側(cè)參數(shù):S=1, a=0.025,,β=0.2,,根據(jù)上面的公式我們可以計算出,,樣本量n為121例。如果考慮10%的脫落剔除率,,那么最低樣本量為121/0.9=135例,。
03
計算樣本量軟件
除了上述樣本量計算公式外,也可以直接借助軟件來計算,,今天小編將重點介紹如下兩種軟件,。
(1) PASS
PASS(Power Analysis and Sample Size)美國NCSS公司開發(fā),,能對數(shù)十種統(tǒng)計學檢驗條件下的檢驗效能和樣本含量進行估計,。
(2) PASS操作
估算原理:采用單組目標值類似原理。在左側(cè)界面中依次選擇“Procedures—“Sensitivity and Specificity—“Test for One-Sample Sensitivity and Specificity”,,然后在面板設置好各個參數(shù),,分別進行靈敏度和特異性的樣本計算,最后軟件計算出不同疾病流行率下所需的最少樣本數(shù)量,,如 Fig.2所示,。
Fig.2 設置參數(shù)界面
Fig.2 參數(shù)界面和結(jié)果
結(jié)果解釋:分別進行陽性、陰性樣本量估算,,每次估算可得到不同疾病流行率下,,診斷靈敏度或診斷特異性所需的陽性和陰性樣本估算結(jié)果,最終陽性和陰性樣本量取兩次估算值的較大值,。
可以分別計算定性、定量產(chǎn)品的樣本量,,另外還可以進行靈敏度,、特異性,置信區(qū)間,、KAPPA,,ROC等分析。如Fig.3,,根據(jù)既定的相關(guān)參數(shù)進行設置后計算出結(jié)果,。
Fig.3 IVD statistics樣本量計算
根據(jù)既定的相關(guān)參數(shù)進行設置后計算出結(jié)果,。
本文中介紹了定性樣本量計算公式,原理是基于可接受標準,,指定置信區(qū)間寬度進行計算,。另外,當靈敏度或特異度小于20%或大于80%時,,樣本率的分布呈偏態(tài)的定性產(chǎn)品的樣本量如何計算,,以及對于定量產(chǎn)品,,可以采用相關(guān)系數(shù)檢驗的公式來估算樣本量。
除此之外,,本文還展現(xiàn)了PASS和IVD statistics軟件,。PASS軟件需考慮疾病流行率來計算樣本量大小。但是由于流行率的參數(shù)來源于相關(guān)文獻記錄或者疾病控制中心的實時監(jiān)控和統(tǒng)計,,考慮疾病的流行率后,,那代表同一個疾病在不同流行期、不同地域都會有變化,,實際執(zhí)行較為困難,。
當然,需要注意的是,,以上樣本量估算方法僅是一些比較常用及實用的方法,。而具體到臨床試驗方案的總體設計上,還需要臨床技術(shù)專家根據(jù)具體的臨床試驗項目且結(jié)合法規(guī),、競品,、經(jīng)驗等多方面因素綜合考量和打磨而最終敲定。
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上述樣本量估算方法的主要依據(jù)為:
①?體外診斷試劑臨床試驗技術(shù)指導原則(2021年第72號)(國家局),;
② Method Comparison and Bias Estimation Using Patient Samples(EP9-A2),;
③ Assessment of the Diagnostic Accuracy of Laboratory Tests Using Receiver Operating Characteristic Curves; Approved Guideline (EP24-A2).
轉(zhuǎn)載自醫(yī)業(yè)觀察